目前国内外的研究已阐明了部分结核分枝杆菌耐药的分子机制， 结核分枝杆菌耐药主要是由下列耐药基因突变或缺失所致：耐利福平 基因是RNA聚合酶p亚单位的编码基因rpoB；耐异烟肼基因包括过氧 化氢酶-过氧化物酶的编码基因KatG，与分枝菌酸生物合成有关的烯 酰基（酰基运载蛋白）还原酶编码基因inhA和酮酰基ACP还原酶编码 基因fabGl组成的操纵子，烷基过氧化氢酶还原酶编码基因ahPC；与脂 肪酸延伸有关的P-酮酰基酰基载体蛋白（ACP）合成酶编码基因kasA；耐链霉素基因包括核糖体蛋白S12编码基因rpsL和16S rRNA编码基 因rrs；耐乙胺丁醇基因是阿拉伯糖基转移酶的编码基因embABC操纵 子；耐吡嗪酰胺基因是吡嗪酰胺酶编码基因PncA；喹诺酮类耐药基因 包括DNA旋转酶A亚单位的编码基因gyrA和B亚单位编码基因 gyrB；耐氨基羟丁基卡那霉素A( AK)、卡那霉素（KM）基因是rrs基因； 耐卷曲霉素（CAP）和紫霉素（VIO）基因是tlyA基因和rrs基因；大环内 酯类药物天然抗药性基因是ermMT(Rvl998)基因。