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按照目前的状况，可以说是也可以说不是。GPU的并行运算能力非常强（基于其每个单元相对简单的设计，可以在有限的芯片空间里容纳非常多单元实现高组合运算），而CPU的并行能力比较弱（基于其每个单元比较复杂，功能大而全，因此有限空间里能容纳的单元数较少，运算能力相对较低），因此在相同芯片面积、制造工艺和耗电量下，GPU的总运算吞吐量明显高于CPU。但是GPU指令集所能进行的运算种类相对CPU指令集所能进行的运算种类要少得多，因此至今还没有实用的可以完全运行在GPU上的操作系统。

高性能计算由于可以将总运算量分解为非常多简易运算，所以可以充分利用GPU的并行运算能力。但有一些CPU的运算吞吐量并不输于中低档次的GPU【比如IBM的Power8处理器，其预估的峰值计算能力超过600 GFlops，超越Nvidia Geforce GT640的运算力】，而且为CPU设计系统软件比为GPU进行软件适配更为简便。因此通常会采用传统对称多CPU架构加多GPU架构的组合式结构搭建高性能计算平台（也就是异构运算），甚至也有使用基于RISC指令集的高性能CPU作为辅助加速核心的高性能计算平台问世（我国的天河一号超级计算机就有采用此种设计）。

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