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是有区别的。

1、成立目的不同。农民专业合作社以服务成员为宗旨，谋求全体成员的共同利益，不以营利为目的；而企业则追求企业利益的最大化。

2、主体不同。农民专业合作社成员以农民为主体；而公司、合伙企业、个人独资企业没有对出资人的身份做特别规定。

3、服务对象不同。农民专业合作社以成员为主要服务对象，提供产前、产中、产后的技术、信息、生产资料购买和农产品的销售、加工、运输、贮藏等服务。而企业则一般没有所谓的内部服务，服务对象主要是面对市场大众。

4、财产关系不同。 农民专业合作社的财产按份额量化到个人，记载在成员账户中。而股份制的企业，股东的出资构成企业的财产，不将企业的财产按份额量化在股东名下。

5、退出机制对法人资产的影响不同。农民专业合作社成员加入自愿、退出自由。成员退出时，可以带走自己加入时的出资和记载在其账户内的由公积金形成的财产份额。 而加入企业的股东一般只能以转让股份的形式退出（减资有特别规定，如企业法人要清偿债务或提供担保），而如果没有人愿意接受你所转让的股份，那么你就根本没法退出，这种退出一般并不带来企业法人资产的减少。

6、地位不同。农民专业合作社成员地位平等，实行民主管理。 而股份制企业则是以股东所持有的股份为决策的基石。

7、分配方式不同。农民专业合作社的盈余主要按成员与农民专业合作社的交易量比例返还，盈余分配的基础是成员对合作社提供服务的利用程度，即“按惠顾额返还盈余”。而一般企业的利润则“按股分红”。

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