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1. 编制不同
聘用制、合同制都是没有事业单位编制的，编制员工是有编制的。
2.合同
聘用制、合同制都是需要签订合同，权利及义务都在合同中体现。合同签约时长根据受聘工作内容而定，通常时限远比合同制员工短，福利待遇比合同制员工除了劳动法所要求的得到保障外，企业本身的一些福利待遇是无法享受到的。
3.待遇问题
合同内定岗定酬，无法享受政府规定的事业单位加工资，加福利等待遇，不享受公费医疗住房补贴子女上学照度等政策，参加社保，工资需要交税；社保的退休金是对照社会平均工资和你交的社保基数综合发放的，基本上是上一年度的平均最低工资稍微高一点，而事业单位有编制退休的拿退休前一年度的全额平均工资，享受公费医疗。
4.上岗方式不同
聘用制员工则是通过竞争取得，确定的形式可以签定聘任合同，也可以签订聘约，或颁发聘书，也可以签订目标责任书。
扩展资料：
聘用制是以合同的形式确定事业单位与职工基本人事关系的一种用人制度，即事业单位工作人员在本单位的身份属性通过与单位签订聘用合同确定。事业单位传统的用人制度是职工一旦被调入或分配到其单位，就终身成为该单位的职工。
聘用制就是要将传统的用人制度改革成为合同契约式的用人制度；聘任制是事业单位内部具体工作岗位的管理制度，是相对委任制而言的。受聘人拟任工作岗位或职务一般通过竞争取得，确定的形式可以签定聘任合同，也可以签订聘约，或颁发聘书，也可以签订目标责任书。在事业单位人事制度改革中，对某一职工既要通过聘用制确定基本人事关系，又要通过聘任明确具体岗位职务。
参考资料：
搜狗百科-聘用制
搜狗百科-合同制
延伸阅读：
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