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Gold的Gold软件
GOLD是一款由英国剑桥大学晶体数据中心开发的一款分子对接程序。GOLD是一个计算大分子与小分子结合模式的分子对接程序,是Sheffield大学,laxoSmithKline公司和CCDC协作的产物。因其准确性和可靠性在分子模拟圈内评价很高。
GOLD的遗传算法最适合虚拟筛选和并行计算。 发布的版本可在商业的PCGRID系统上使用。它采用遗传算法(GA)进行蛋白-配体对接;对接时配体完全柔性和蛋白部分柔性;能量函数部分依赖于来自CSD数据库的构象和非键接触;打分函数有GoldScore、ChemScore和用户自己定义的打分函数;多种限制选项;对接结果后处理工具:SILVER;自动考虑活性口袋内结合的水分子;改进的处理金属配位结构方法;对特别的配体自动衍生GA设置。
清华大学、中科院上海药物研究所等大型科研单位都已引进该软件,与LigandScout配套使用。国内大多生物药物企业生产药品是将国外过期专利廉价打包购买回来宣称填补国内空白,很少有能力在药物方面进行尖端科研。Gold是进行尖端科研必备软件之一。
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